本发明属于分子生物学，涉及一种与猪肋骨数性状相关的snp标记引物对及其应用。
背景技术：
1、中国是猪肉生产和消费大国，在中国人饮食结构中，猪肉是国民动物蛋白质的主要来源。随着经济的发展和生活质量的不断提升，人们对于猪肉的需求量日益增加，如何提高猪胴体产肉率以满足市场对猪肉的需求是目前育种工作的重点。
2、猪的脊柱可分为颈椎、胸椎、腰椎、荐椎和尾椎，其中仅胸椎数和腰椎数存在变异。胸椎与肋骨相连，胸椎的数目决定了肋骨的数目。肋骨数与猪的胴体长显著相关，每增加1对肋骨不仅增加排骨和里脊肉的量，且使体长增加10-40mm，猪的产肉量也增加约1％。“猪排骨”是中国猪肉消费市场售价最高的胴体部位之一，由于瘦肉率高、肉质好深受消费者青睐。因此，研究猪肋骨数的遗传分子机理并将相关的分子标记应用于育种工作中，对于选育多肋骨数和高产肉率的群体或新品系具有重要的经济价值。
技术实现思路
1、本发明的目的在于针对传统猪肋骨数选育耗时费力，表型测定困难，选育效果慢，提供与猪肋骨数相关的snp标记开发而成的选育分子标记。
2、本发明的另一个目的在于提供用于检测上述snp标记的引物对和检测方法。本发明的另一个目的在于提供上述snp标记、分子标记、引物的用途。
3、本发明的目的可通过以下技术方案实现：
4、一种与猪肋骨数性状相关的分子标记，所述的分子标记序列如seq id no：1所示，其中含有一个与猪肋骨数性状相关的snp标记位点，该位点为国际猪基因组11.1版本参考序列猪6号染色体rs332644388核苷酸位点，在seq id no：1中所述的snp标记位点位于第301位，存在a/g多态性；gg型和ag型个体的肋骨数均极显著多于aa型的个体，gg型个体的肋骨数显著多于ag型的个体。
5、一种用于检测与猪肋骨数性状相关的snp标记的引物对，上游引物为：seq id no：2，下游引物为：seq id no：3。
6、本发明所述的分子标记、所述的引物对在检测猪肋骨数性状和/或猪育种中的应用。
7、一种检测所述的与猪肋骨数性状相关的snp标记的方法，包含pcr扩增猪国际猪基因组11.1版本参考序列猪6号染色体rs332644388核苷酸位点的一段序列，对扩增产物进行测序，判读该位点的a/g多态性。
8、作为本发明的一种优选，利用本发明所述的引物对对猪基因组dna进行pcr扩增。
9、作为本发明的进一步优选，所述的方法包括以下步骤：
10、(1)取猪组织样品提取总dna；
11、(2)用已提取的猪基因组dna为模板，使用本发明所述的引物对进行pcr扩增；
12、(3)扩增产物进行测序，分析测序结果，判读在seq id no：1第301位的a/g多态性。
13、本发明所述的分子标记在筛选、建立多肋骨猪群体或新品系中的应用。
14、本发明所述的引物对在筛选、建立多肋骨猪群体或新品系中的应用。
15、一种筛选多肋骨猪群体的方法，包括检测猪国际猪基因组11.1版本参考序列猪6号染色体rs332644388核苷酸位点的基因型，；gg型和ag型个体的肋骨数均极显著多于aa型的个体，gg型个体的肋骨数显著多于ag型的个体，选育rs332644388核苷酸位点的gg型和/或ag型个体优先作为后备种猪留种。
16、作为本发明的一种优选，检测猪国际猪基因组11.1版本参考序列猪6号染色体rs332644388核苷酸位点的基因型的方法选自pcr或基因测序。
17、有益效果
18、本发明开发了与猪肋骨数相关的snp标记，并且提供了检测该标记的引物对和方法。通过鉴定该snp标记的基因型来筛选具有多肋骨的猪新品系。该品系的建立能够提高猪的产肉性能和肋骨数，提高高价部位在猪胴体的分布比例，并且产生更多的社会和经济效益。
1.一种与猪肋骨数性状相关的分子标记，其特征在于所述的分子标记序列如seq idno：1所示，其中含有一个与猪肋骨数性状相关的snp标记位点，该位点为国际猪基因组11.1版本参考序列猪6号染色体rs332644388核苷酸位点，在seq id no：1中所述的snp标记位点位于第301位，存在a/g多态性；gg型和ag型个体的肋骨数均极显著多于aa型的个体，gg型个体的肋骨数显著多于ag型的个体。
2.一种用于检测权利要求1中所述的与猪肋骨数性状相关的snp标记的引物对，其特征在于上游引物为：seq id no：2，下游引物为：seq id no：3。
3.权利要求1所述的分子标记、权利要求2所述的引物对在检测猪肋骨数性状和/或猪育种中的应用。
4.一种检测权利要求1中所述的与猪肋骨数性状相关的snp标记的方法，其特征在于pcr扩增包含猪国际猪基因组11.1版本参考序列猪6号染色体rs332644388核苷酸位点的一段序列，对扩增产物进行测序，判读该位点的a/g多态性。
5.根据权利要求5所述的方法，其特征在于利用权利要求2所述的引物对对猪基因组dna进行pcr扩增。
6.根据权利要求6所述的方法，检测与猪肋骨数性状相关的snp标记在筛选多肋骨猪群体中的应用，其特征在于包括以下步骤：
7.一种筛选多肋骨猪群体的方法，其特征在于包括检测猪国际猪基因组11.1版本参考序列猪6号染色体rs332644388核苷酸位点的基因型，gg型和ag型个体的肋骨数均极显著多于aa型的个体，gg型个体的肋骨数显著多于ag型的个体，选育rs332644388核苷酸位点为gg型和/或ag型个体作为后备种猪留种。
8.根据权利要求8所述的方法，其特征在于检测猪国际猪基因组11.1版本参考序列猪6号染色体rs332644388核苷酸位点的基因型的方法选自pcr或基因测序。
