本发明涉及分子生物学检测,尤其涉及一种检测妊娠糖尿病遗传易感性的snp位点组合、产品、试剂盒以及方法。
背景技术:
1、妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus ,gdm)是妊娠期常见疾病,由首次诊断为高血糖决定。gdm在一定程度上对孕妇和胎儿的健康有害。对于孕妇来说,它可能会增加并发症的发生率,如妊娠高血压、心血管疾病和糖代谢抑制。对于胎儿来说,存在早产和新生儿低血糖的风险。因此,为了预防和治疗gdm的发生,有必要探讨其发病机制和危险因素。gdm的发病机制可能包括胰岛素分泌受损和胰岛素抵抗。饮食、环境和遗传因素有助于gdm的发展,其中单核苷酸多态性(snps)是一个重要的遗传变异因素。
2、小rna(mirna)在妊娠期间的代谢信号通路中发挥关键调节作用,可能影响胰岛β细胞分化和胰岛发育。越来越多的研究表明,mirna中的snp对其成熟、表达和功能有影响。mirna表达的失调与癌症、糖尿病和心血管疾病的发展相关。
3、虽然现有技术中有针对基因的单一多态性位点与gdm的相关性的研究,但是灵敏度均不高;另外,现有技术中也缺乏通过mirna的单核苷酸多态性检测gdm遗传易感性的试剂盒,无法及时筛查出gdm易感高危人群,故无法提前做好gdm预防措施。
技术实现思路
1、为解决上述技术问题,本发明的目的在于提供一种检测妊娠糖尿病遗传易感性的snp位点组合、产品、试剂盒以及方法,该试剂盒通过检测与gdm遗传易感性密切相关的mir-196a2 rs11614913和mir-27a rs895819两个位点的联合基因型和单倍型,可有效筛查出gdm遗传易感高危人群,从而为及早进行个性化干预和治疗提供重要依据。
2、为达到上述技术效果,本发明采用了以下技术方案:
3、第一方面,本发明提供一种检测妊娠糖尿病遗传易感性的snp位点组合,包括:
4、位于mir-196a2基因上的rs11614913号snp位点i和位于mir-27a基因上的rs895819号snp位点ii。
5、第二方面,本发明还提供一种检测妊娠糖尿病遗传易感性的snp位点组合在制备预测妊娠糖尿病患病风险的产品中的用途,或,在制备筛查或辅助筛查妊娠糖尿病的产品中的用途。
6、进一步地,上述用途包括步骤:
7、获取受试者的生物样本,提取所述生物样本的样本dna;
8、检测所述样本dna在所述snp位点i和snp位点ii的碱基序列,并以此确定受试者在snp位点i和snp位点ii的基因型。
9、优选地,所述生物样品来源于人的血液、粪便、尿液、口腔上皮细胞、脱落细胞、口腔拭子或咽喉拭子中的任意一种,且优选为血液样本。
10、第三方面,本发明还提供一种检测妊娠糖尿病遗传易感性的产品,该产品包括用于检测位于mir-196a2基因上的rs11614913号snp位点i和位于mir-27a基因上的rs895819号snp位点ii的基因型的试剂,优选地,所述产品为试剂盒。
11、第四方面,本发明还提供一种检测妊娠糖尿病遗传易感性的试剂盒,该试剂盒至少包括特异性引物对i和/或特异性引物对ii:
12、所述特异性引物对i用于特异性扩增包含snp位点i的核苷酸片段;
13、所述特异性引物对ii用于特异性扩增包含snp位点ii的核苷酸片段;
14、其中,所述snp位点i为位于mir-196a2基因上的rs11614913号snp位点,所述snp位点ii为位于mir-27a基因上的rs895819号snp位点。
15、优选地,所述特异性引物对i包括核苷酸序列如seq id no:1所示的上游引物和核苷酸序列如seq id no:2所示的下游引物;
16、优选地,所述特异性引物对ii包括核苷酸序列如seq id no:3所示的上游引物和核苷酸序列如seq id no:4所示的下游引物。
17、优选地,所述试剂盒还包括:特异性荧光探针、无核酶水、缓冲液、dntp混合液、dna聚合酶中的一种或多种。
18、优选地,所述特异性荧光探针包括特异性荧光探针对i和/或特异性荧光探针对ii,所述特异性荧光探针对i包括核苷酸序列如seq id no:5所示的带vic荧光基团探针i和核苷酸序列如seq id no:6所示的带fam荧光基团探针i;所述特异性荧光探针对ii包括核苷酸序列如seq id no:7所示的带vic荧光基团探针ii和核苷酸序列如seq id no:8所示的带fam荧光基团探针ii。
19、第四方面,本发明还提供一种检测妊娠糖尿病遗传易感性的方法,包括步骤:
20、获取受试者的生物样本,提取所述生物样本的样本dna;
21、通过荧光定量pcr反应对样本dna中包括snp位点i和snp位点ii的核苷酸片段进行扩增,并对荧光定量pcr反应过程中产生的荧光信号进行收集,通过对荧光信号进行分析确定受试者在snp位点i和snp位点ii的基因型。
22、与现有技术相比,本发明的有益效果为:
23、基于现有技术中缺乏针对妊娠糖尿病遗传易感性的试剂盒,而且针对单个snp位点进行分析评估gdm发病风险的敏感性和特异性、实用性较差的缺陷,首次提出同时检测mir-196a2 rs11614913 snp位点i和mir-27a rs895819 snp位点ii的组合基因型和单倍型,采用snp位点i基因分型和snp位点ii基因分型结合的方式,可极大地提高预测的准确性,从而有效预测gdm发病风险,便于针对高风险受试者采取更精准的营养干预及保健措施,让妊娠糖尿病高危易感人群在孕前及怀孕早期做充分准备,以降低患妊娠糖尿病的风险及减少妊娠糖尿病所致的不良母婴结局,具有极大的临床应用价值。
1.一种检测妊娠糖尿病遗传易感性的snp位点组合,其特征在于,包括:
2.如权利要求1所述的一种检测妊娠糖尿病遗传易感性的snp位点组合在制备预测妊娠糖尿病患病风险的产品中的用途,或,在制备筛查或辅助筛查妊娠糖尿病的产品中的用途。
3.如权利要求2所述的用途,其特征在于,包括步骤:
4.如权利要求3所述的用途,其特征在于,所述生物样品来源于人的血液、粪便、尿液、口腔上皮细胞、脱落细胞、口腔拭子或咽喉拭子中的任意一种。
5.一种检测妊娠糖尿病遗传易感性的产品,其特征在于:包括用于检测位于mir-196a2基因上的rs11614913号snp位点i和位于mir-27a基因上的rs895819号snp位点ii的基因型的试剂,优选地,所述产品为试剂盒。
6.一种检测妊娠糖尿病遗传易感性的试剂盒,其特征在于:包括特异性引物对i和/或特异性引物对ii;
7.如权利要求6所述的一种检测妊娠糖尿病遗传易感性的试剂盒,其特征在于:
8.如权利要求6所述的一种检测妊娠糖尿病遗传易感性的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括:特异性荧光探针、无核酶水、缓冲液、dntp混合液、dna聚合酶中的一种或多种。
9.如权利要求8所述的一种检测妊娠糖尿病遗传易感性的试剂盒,其特征在于:
10.一种检测妊娠糖尿病遗传易感性的方法,其特征在于,包括步骤: