基于网络药理学分析野鸢尾黄素抗急性肺损伤作用机制的方法

专利检索2025-08-01  6


本发明涉及生物医药领域,具体涉及一种基于网络药理学分析野鸢尾黄素抗急性肺损伤作用机制的方法。


背景技术:

1、急性肺损伤(acute lung injury,ali)是一种严重威胁生命的呼吸系统疾病,伴有无法控制的严重肺部炎症。ali通常由肺炎、脓毒症、严重创伤或酸吸入引发,并可能发展为高度致命的急性呼吸窘迫综合征(ards),伴有呼吸衰竭和低氧血症。ali/ards的特征是肺水肿、弥漫性肺泡损伤、血管通透性增高、炎症细胞浸润、促炎细胞因子积聚和肺泡上皮细胞死亡。肺保护性机械通气是治疗急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征(ali/ards)的重要手段,但不适当的机械通气可导致局部和全身炎症反应,进一步加重肺损伤。抗氧化剂、抗凝血剂、他汀类药物、β-激动剂和神经肌肉阻滞剂等药物,已用于ali/ards的药物治疗。然而,没有对疾病发展和死亡率具有显著和一致影响的药物治疗。因此,寻找有效的治疗药物来改善ali患者的临床预后是非常必要的。

2、鉴于ali发病机制的复杂性,各种天然产物作为减轻炎症和改善肺功能的多效性药物引起了研究者的关注,研究天然化合物在各种人类疾病中的分子靶点和药理学机制,对抗急性肺损伤药物的开发具有重要意义。


技术实现思路

1、有鉴于此,本发明的目的在于提供一种基于网络药理学分析野鸢尾黄素抗急性肺损伤作用机制的方法,还提供该方法验证得到的可以抗急性肺损伤药物的作用靶点。

2、为达到上述目的,本发明提供如下技术方案:

3、1.基于网络药理学分析野鸢尾黄素抗急性肺损伤作用机制的方法,所述方法包括以下步骤:

4、a.在pharmmpper数据库、targetnet数据库和swisstargetprediction数据库分别输入野鸢尾黄素分子式查找野鸢尾黄素作用靶点;

5、b.以“acute lung injury”为关键词,在genecards数据库、disgenet数据库、ctd数据库、disgenet数据库查询相关疾病靶点,然后将疾病靶点与步骤a所得的野鸢尾黄素靶点进行venn图映射交集处理,获得野鸢尾黄素-急性肺损伤交集靶基因;

6、c.将步骤b的交集靶基因上传到string数据库,在multiple proteins项下检索organism:homo sapiens,分析页面中设定high confidence:0.7,得到靶点蛋白互作网络及tsv.数据,同时在cytoscape软件中的networkanalyzer模块分析互作网络中所有节点的拓扑参数,选取节点连接度、介数中心性和接近中心性中位数作为核心靶点的筛选条件;

7、d.运用metascape数据库对核心靶点进行go生物过程和kegg通路注释富集分析,输出其相应柱状图、气泡图,预测靶点的功能分布,并根据富集因子分析核心通路富集程度,得到关键核心靶点参与的关键通路信息,从而解析野鸢尾黄素抗急性肺损伤的作用机制。

8、进一步所述的方法中,步骤a中以“irigenin”为关键词于pubchem数据库搜索,得到野鸢尾黄素结构式。

9、进一步所述的方法中,步骤a中targetnet数据库筛选阈值为prob>0,swisstargetprediction数据库筛选阈值为probability*分值>0。

10、进一步所述的方法中,步骤b中在genecards数据库筛选阈值为“relevance score>=20”,ctd数据库筛选阈值为“inference score>=50”。

11、进一步所述的方法中,步骤c中筛选时,先以两倍节点连接度为筛选范围下限,符合条件的核心靶点将进行下一步分析,再以节点连接度、介数中心性和接近中心性的中位数为筛选范围下限,进行下一步分析。

12、进一步所述的方法中,用生物在线工具进行venn图映射交集处理。

13、进一步所述的方法中,所述方法还包括野鸢尾黄素对急性肺损伤小鼠模型的验证。

14、2.野鸢尾黄素在制备抗急性肺损伤药物中的应用。

15、野鸢尾黄素的结构式如式i所示:

16、

17、野鸢尾黄素抗急性肺损伤的作用靶点为egfr、hras、akt1、src、hsp90aa1、rhoa、il2、mapk14、ptpn11或/和ptk2。

18、3.抗急性肺损伤药物的靶点,所述靶点为egfr、hras、akt1、src、hsp90aa1、rhoa、il2、mapk14、ptpn11或/和ptk2。

19、本发明的有益效果在于:本发明提供了抗急性肺损伤药物开发新模式和新思路,建立了一种基于网络药理学分析野鸢尾黄素抗急性肺损伤作用机制的方法,并通过该方法首次构建了野鸢尾黄素作为药物成分在抗急性肺损伤作用的相关网络图,确认中药单体野鸢尾黄素作用于急性肺损伤疾病的egfr、hras、akt1、src、hsp90aa1、rhoa、il2、mapk14、ptpn11和ptk2等10个相关疾病核心靶点,并基于此靶点来研究野鸢尾黄素抗急性肺损伤的功能和药理作用机制,为研究急性肺损伤疾病开发更多的新药研究打下基础,也为抗急性肺损伤药物的开发提供重要的指导和依据。

20、本发明共筛选出184个可能作为野鸢尾黄素治疗ali的交集靶点基因。ppi网络显示egfr、hras、akt1、src和hsp90aa1为前五位重要枢纽基因。go和kegg富集实验表明,多种生物学过程参与了ali的治疗,如蛋白磷酸化、对脂多糖的应答、炎症反应的调节、细胞因子产生的正调节和细胞死亡的正调节。根据kegg结果,这些基因主要富集在癌症、脂质和动脉粥样硬化中的途径、mapk信号传导途径、化学致癌-活性氧物质、foxo信号传导途径和vegf信号传导途径中。值得注意的是,mapk信号是与ali相关的最重要的信号。mapk通路的抑制可降低肺通透性,抑制了系统炎症,减轻脓毒症引起的肺损伤。mapk信号传导也被证明是几种天然产物对lps诱导的ali的保护作用的原因。从网络药理学的数据推测,野鸢尾黄素可以发挥对ali的治疗作用,通过调节炎症反应,细胞因子的产生,并用动物实验首次证明了野鸢尾黄素可通过抑制炎症和细胞凋亡减轻lps诱导的ali,其抗ali作用部分归因于mapk信号通路的失活。野鸢尾黄素对急性肺损伤有保护作用,可应用于治疗或预防急性肺损伤的治疗药物中。



技术特征:

1.基于网络药理学分析野鸢尾黄素抗急性肺损伤作用机制的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的基于网络药理学分析野鸢尾黄素抗急性肺损伤作用机制的方法,其特征在于,步骤a中以“irigenin”为关键词于pubchem数据库搜索,得到野鸢尾黄素结构式。

3.根据权利要求1所述的基于网络药理学分析野鸢尾黄素抗急性肺损伤作用机制的方法,其特征在于,步骤a中targetnet数据库筛选阈值为prob>0,swisstargetprediction数据库筛选阈值为probability*分值>0。

4.根据权利要求1所述的基于网络药理学分析野鸢尾黄素抗急性肺损伤作用机制的方法,其特征在于,步骤b中在genecards数据库筛选阈值为“relevance score>=20”,ctd数据库筛选阈值为“inference score>=50”。

5.根据权利要求1所述的基于网络药理学分析野鸢尾黄素抗急性肺损伤作用机制的方法,其特征在于,步骤c中筛选时,先以两倍节点连接度为筛选范围下限,符合条件的核心靶点将进行下一步分析,再以节点连接度、介数中心性和接近中心性的中位数为筛选范围下限,进行下一步分析。

6.根据权利要求1所述的基于网络药理学分析野鸢尾黄素抗急性肺损伤作用机制的方法,其特征在于,用生物在线工具进行venn图映射交集处理。

7.根据权利要求1所述的基于网络药理学分析野鸢尾黄素抗急性肺损伤作用机制的方法,其特征在于,所述方法还包括野鸢尾黄素对急性肺损伤小鼠模型的验证。

8.野鸢尾黄素在制备抗急性肺损伤药物中的应用。

9.根据权利要求8所述的应用,其特征在于,野鸢尾黄素的结构式如式i所示:

10.抗急性肺损伤药物的靶点,其特征在于,所述靶点为egfr、hras、akt1、src、hsp90aa1、rhoa、il2、mapk14、ptpn11或/和ptk2。


技术总结
本发明涉及一种基于网络药理学分析野鸢尾黄素抗急性肺损伤作用机制的方法,并通过该方法首次构建了野鸢尾黄素作为药物成分在抗急性肺损伤作用的相关网络图,确认中药单体野鸢尾黄素作用于急性肺损伤疾病的EGFR、HRAS、AKT1、SRC、HSP90AA1、RHOA、IL2、MAPK14、PTPN11和PTK2等10个相关疾病核心靶点,并基于此靶点来研究野鸢尾黄素抗急性肺损伤的功能和药理作用机制,为研究急性肺损伤疾病开发更多的新药研究打下基础,也为抗急性肺损伤药物的开发提供重要的指导和依据。对我国丰富中药资源的开发与产业化具有突破性意义。

技术研发人员:刘丹,王强,王庆,袁文
受保护的技术使用者:中国人民解放军陆军军医大学第二附属医院
技术研发日:
技术公布日:2024/5/29
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