本发明属于分子生物学,特别是涉及一种识别原多甲藻酸-1的核酸适配体及其应用。
背景技术:
1、原多甲藻酸(azaspiracids, azas)是一类属于原多甲藻酸族(azaspiracidshellfish poisoning, azps)的亲脂聚醚海洋毒素,由原多甲藻(protoperidiniumcrassipes)产生。误食受azas污染的贝类后,会引起恶心、呕吐、严重腹泻和胃肠部痉挛等不适,该中毒症状与腹泻性贝毒 (diarrhetic shellfish poison,dsp)引起的中毒症状非常相似。此外,azas的毒性比较稳定,常规的烹饪和加工处理无法去除。建立有效的azas检测方法对该类海洋贝类毒素进行密切监控,对于提高水产品安全、保护人体健康具有非常重要的意义。
2、目前已发现70多种azas异构体,其中原多甲藻酸-1(azaspiracid-1, aza1)广泛存在。目前原多甲藻酸监测方法主要有小鼠检测法、液相色谱-串联质谱联用、免疫测定技术等。缺陷在于:小鼠检测法往往存在大量假阳性和假阴性结果,可信度不高;液相色谱-串联质谱联用技术成本高、检测时间长、对检测人员要求高、操作比较复杂,不适于高通量检测;免疫测定技术所用抗体应用成本高、储存条件苛刻、稳定性有限。
3、核酸适配体(aptamer)是基于指数富集的配体系统进化技术(systematicevolution of ligands by exponential enrichment,selex)从随机寡核苷酸文库中筛选获得的对靶物质(如细胞、病毒、毒素、蛋白质和维生素等)具有很高特异性与亲和力的寡核苷酸序列。与传统的识别元件体相比,适配体易于体外大量合成,重复性好、稳定性高、成本低,可应用于各类生物传感器中,在细胞生物学、生物医学、食品安全检测中具有巨大潜力。目前尚未见有关于原多甲藻酸核酸适配体筛选的报导。
技术实现思路
1、本发明的目的在于提供一种识别原多甲藻酸-1的核酸适配体及其应用。
2、为了实现上述目的,本发明采用以下技术方案:
3、一种识别原多甲藻酸-1的核酸适配体,核酸适配体包括下列选择,
4、(1):aza-apt-02 所示的核苷酸序列;
5、或(2):aza-apt-09 所示的核苷酸序列;
6、或(3):aza-apt-23 所示的核苷酸序列;
7、或(4):aza-apt-23b48 所示的核苷酸序列;
8、或(5):具有与(1)或(2)或(3)或(4)的序列至少90%同源性且能特异性结合aza1的核苷酸序列;
9、或(6):(1)、(2)、(3)、(4)的序列或具有与(1)或(2)或(3)或(4)的序列至少90%同源性且能特异性结合aza1的核苷酸序列被化学修饰的核酸序列。
10、所述化学修饰为以下任意一种或多种:硫代修饰、磷酸化修饰、甲基化修饰、氨基化修饰、巯基化修饰、硒取代氧修饰或连接同位素修饰。
11、作为对上述技术方案的改进,可对上述核酸适配体核苷酸序列上的某一位置进行修饰,例如,磷酸化、甲基化、氨基化、巯基化、用硫取代氧、用硒取代氧或连接同位素化等,保证修饰后得到的核酸适配体序列具有合乎需要的性质,例如,可以具有与修饰前的母体核酸适配体序列相等或更高的结合aza1的亲和力,或虽没有明显提升亲和力但稳定性更高。
12、所述适配体或修饰后适配体进一步连接标记物。
13、所述标记物包括荧光标记物、纳米发光材料标记物、小肽标记物、放射性标记物、地高辛标记物、sirna标记物、治疗性标记物、生物素标记物或酶标记物。
14、作为对上述技术方案的改进,可在上述核酸适配体的核苷酸序列上连接荧光标记物、地高辛标记物、放射性标记物、纳米发光材料标记物、治疗性标记物、小肽标记物、生物素标记物、酶标记物或sirna标记物等,保证修饰后得到的核酸适配体序列具有合乎需要的性质,例如,可以具有与修饰前的母体核酸适配体序列相等或更高的结合aza1的亲和力,或虽没有明显提升亲和力但稳定性更高。
15、aza-apt-02:agcagcacagaggtcagatggccccccgtatttgtattacctatgcgtgcctatgcgtgctaccgtgaa
16、aza-apt-09:agcagcacagaggtcagatgccccagctggacccatgacccccggagggcctatgcgtgctaccgtgaa
17、aza-apt-23:agcagcacagaggtcagatgcagctcaagttcaaattgtgtgttcggtacctatgcgtgctaccgtgaa
18、aza-apt-23b48:acagaggtcagatgcagctcaagttcaaattgtgtgttcggtacctat。
19、一种所述核酸适配体的应用,所述适配体在下述任意一种中的应用:
20、(1)分离纯化 aza1中的应用;
21、(2)标记 aza1中的应用;
22、(3)定量或定性检测 aza1中的应用;
23、(4)制备用于靶向 aza1的试剂或药物中的应用;
24、(5)制备用于分析、检测、诊断或治疗 aza1相关疾病的试剂或药物或试剂盒中的应用。
25、所述aza1结构式为:。
26、综上所述,本发明的优点及积极效果为:
27、(1)本发明采用mrgo-selex技术,以aza1作为靶标,筛选了一组对aza1具有高亲和力和高特异性的核酸适配体,扩充了检测aza1的分子探针种类。
28、(2)与抗体相比,该核酸适配体具有分子量小、稳定性好、易于修饰、可以通过人工合成等优势,免去了动物免疫、饲养、蛋白提取和纯化等一系列流程,获取成本低,是理想的分子探针。
1.一种识别原多甲藻酸-1的核酸适配体,其特征在于,核酸适配体包括下列选择,
2.根据权利要求1所述的识别原多甲藻酸-1的核酸适配体,其特征在于:所述化学修饰为以下任意一种或多种:硫代修饰、磷酸化修饰、甲基化修饰、氨基化修饰、巯基化修饰、硒取代氧修饰或连接同位素修饰。
3.根据权利要求1或2所述的识别原多甲藻酸-1的核酸适配体,其特征在于:所述适配体或修饰后适配体进一步连接标记物。
4.根据权利要求3所述的识别原多甲藻酸-1的核酸适配体,其特征在于:所述标记物包括荧光标记物、纳米发光材料标记物、小肽标记物、放射性标记物、地高辛标记物、sirna标记物、治疗性标记物、生物素标记物或酶标记物。
5.根据权利要求1所述的识别原多甲藻酸-1的核酸适配体,其特征在于:
6.一种权利要求1所述核酸适配体在下述任意一种中的应用,