本发明属于遗传生物学领域,具体涉及一种与绵羊耳长相关的snp分子标记及其应用。
背景技术:
1、在动物形态学研究中,关于动物耳朵长度的探讨并不如其他生理特征那样广泛,国内外的相关报道相对较少。耳朵作为动物重要的感官器官,不仅关系到听觉的灵敏度,还可能与动物的体温调节有关。在自然界中,多数动物的耳朵都是适中或小型的,然而,也存在着一些动物,比如某些品种的兔子和一些沙漠生活的哺乳动物,它们的耳朵显著较长。长耳朵可能有助于捕捉更微弱的声音,这在荒漠和其他开阔地带对于察觉远处的捕食者和同伴的信号至关重要。同时,耳朵的长度和表面积的增加也有助于热量的散发,对于在热环境下生活的动物来说,这是一种有效的散热机制。
2、在绵羊这一特定群体中,耳朵长度的变化也是适应性进化的结果。传统上,绵羊被认为具有适中长度的耳朵,但在某些品种中,人们观察到耳朵长度的差异。这些差异可能与羊只的生活环境、遗传背景以及人为选择有关。长耳朵的绵羊可能在视觉和听觉上具有某些优势,但如果耳朵过长,也可能会影响它们的日常活动,比如觅食或逃避捕食者时的灵活性。
3、随着分子生物学和基因组学的发展,通过分子标记进行动物育种变得可行。对绵羊耳朵长度的研究,不仅可以揭示耳朵长度变异的遗传基础,而且可以在育种中应用,选择具有理想耳朵长度的羊只,以适应特定的环境和管理要求。因此,这一领域的研究对于增强羊群的环境适应性和福利具有实际和潜在的价值。到目前为止,关于绵羊耳朵长度的详细遗传研究报道还不多见。
技术实现思路
1、本发明的主要目的在于提供一种与绵羊耳朵长度相关的snp分子标记,采用该snp分子标记可精确的进行基因选择,从而高效的培育出理想耳长的绵羊,弥补了现有技术中缺乏与绵羊耳朵长度直接相关的snp分子标记的技术缺陷。
2、本发明采用了以下技术方案来实现上述目的:
3、一种影响绵羊耳朵长度的snp分子标记,其特征在于,所述snp分子标记位于第3号染色体上154502516位点,该snp分子标记的多态性为a/g。
4、本发明提供所述的snp分子标记在鉴定绵羊耳朵长度中的应用。
5、一种利用上述snp分子标记鉴定绵羊耳朵长度的方法,包括以下步骤:
6、(1)提取待测绵羊的dna;
7、(2)以待测绵羊基因组dna为模板,利用snp分子标记的特异性引物进行pcr扩增,获得pcr产物;
8、(3)对pcr产物进行测序,分析基因型;
9、(4)结果判断:根据基因型不同判断绵羊耳朵长度属于短耳型、中耳型或长耳型;第3号染色体154502516位点基因为gg的绵羊为短耳型;第3号染色体154502516位点基因为ag的绵羊为中耳型;第3号染色体154502516位点基因为aa的绵羊为长耳型;
10、所述的特异性引物包括:
11、正向引物1(f1):gaaggtcggagtcaacggattcaaagttcacaaaagaagaatgc;
12、正向引物2(f2):gaaggtgaccaagttcatgctccaaagttcacaaaagaagaatgt;反向引物(r):agacttacaaaaggcaatggc
13、进一步的,上述方法中pcr扩增的退火温度为55-61℃。
14、本发明还提供了上述snp分子标记鉴定绵羊耳朵长度的方法在绵羊育种中的应用。
15、本发明具有以下有益效果:
16、绵羊耳朵长度影响其环境感知能力,尤其是在开阔地带对于捕食者声音的捕捉上,长耳朵有助于羊群及时发现危险并作出反应。同时,耳朵的长度和形状也关系到绵羊的散热效率,对于适应不同气候环境有重要作用。通过本发明提供的snp分子标记,可以在育种中选择适宜耳朵长度的个体,既可以增强羊群的生存能力,又可以优化其繁殖性能和生长环境的适应性。
1.一种影响绵羊耳朵长度的snp分子标记,其特征在于,所述snp分子标记位于第3号染色体上154502516位点,该snp分子标记的多态性为a/g。
2.一种如权利要求1所述的snp分子标记在鉴定绵羊耳朵长度中的应用。
3.一种利用snp分子标记鉴定绵羊耳朵长度的方法,其特征在于,包括以下步骤:
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,pcr扩增的退火温度为55-61℃。
5.一种如权利要求3或4所述的方法在绵羊育种中的应用。